در حالی که به تازگی اخباری از انتخاب مجتبی جباری در کادر مدیریتی آکادمی استقلال منتشر شده بود، اما شنیده‌ها حاکی از آن است که ستاره سابق استقلال قید ادامه همکاری با این مجموعه را زده است. بر همین اساس جباری قرار بود در کنار مدیریت فنی در آکادمی، نقش رابط میان تیم بزرگسالان و تیم‌های پایه را نیز ایفا کند، اما به نظر می‌رسد تداخل مسئولیت‌ها و برخی اتفاقات پشت پرده، مسیر همکاری او با استقلال را پیچیده کرده است.
بر همین اساس مطرح شدن نام جباری به عنوان مدیرفنی آکادمی استقلال، واکنش‌هایی را در میان پیشکسوتان باشگاه به همراه داشته است. علی جباری، پیشکسوت نام آشنای استقلال، با انتقاد از این شرایط گفته بود: «مگر قحط الرجال است که باشگاه از یک نفر در چند سمت استفاده می‌کند؟ او به اندازه کافی در تیم اصلی سرش شلوغ است. من نمی‌دانم چگونه می‌تواند به صورت همزمان در دو جا کار کند؟ یعنی در مجموعه استقلال یک پیشکسوت پیدا نمی‌شود که مدیر آکادمی شود؟» در کنار این حواشی گفته می‌شود برخی چهره‌ها که در کنار علیرضا اسدی، مسئول جدید آکادمی، ایفای نقش می‌کنند، در فرایند تصمیم گیری‌های فنی و اجرایی این مجموعه حضور پررنگی دارند. موضوعی که احتمالاً با دیدگاه‌های جباری همخوانی نداشته و از دلایل دیگر انصراف او از ادامه فعالیت در آکادمی بوده است.
باشگاه استقلال هنوز واکنشی به این موضوع نداشته، اما به نظر می‌رسد آینده همکاری مجتبی جباری با آکادمی باشگاه در هاله‌ای از ابهام قرار دارد. این در حالی است که با حضور جباری در کادر فنی تیم بزرگسالان به عنوان دستیار میودراگ بوژوویچ و احتمال جدایی قریب الوقوع سرمربی صرب، زمزمه‌هایی درباره سرمربیگری موقت جباری تا پایان فصل مطرح شده است.
