آیت‌الله علی اکبر کلانتری دانشیار دانشگاه شیراز و نماینده فارس در مجلس خبرگان رهبری در نامه‌ای در پاسخ به اهانت و ادعای وزیر علوم مبنی بر عدم سرقت علمی رئیس جمهور عنوان کرد: با کمال تاسف اطلاع یافتم در خصوص اتهام وقوع کپی برداری در تز منسوب به جناب آقای روحانی از کتاب اینجانب، سخنانی ابراز کرده‌اید که فاقد هرگونه وجاهت علمی و به وضوح غیر کارشناسانه است.
کلانتری در این نامه آورده است: جای بسی تاسف است که به جای آنکه حضرتعالی مدافع حقوق یکی از اعضای هیات علمی زیر مجموعه خود باشید و خواسته مشروع او را منصفانه مورد بررسی قرار دهید در اقدامی عجولانه به حمایت از ایشان برخاسته و به راحتی سخن بنده را تکذیب می‌کنید (کاری که خود، اتهام زنی به بنده است.)
در این نامه اعلام شد: آیا معنای حقوق شهروندی شما این است؟ فصل‌های متعدد تز آقای روحانی به کپی برداری از کتاب‌های دیگران متهم است ولی همه سخن این جانب ناظر به فصل چهارم این تز است که بر اساس تحقیقات گسترده و بر پایه اظهار نظر کارشناسان متعدد، بیش از هفتاد درصد آن کپی شده از کتاب اینجانب با عنوان حکم ثانوی در تشریع اسلامی است آن هم بدون رفرنس به این کتاب.
کلانتری در این نامه خطاب به فرهادی آورده است: کمترین انتظار از وزیری که در راس یک مجموعه علمی قرار دارد آن است که به دور از هرگونه حب و بغض سیاسی و صرفا بر اساس عدالت و تقوا به احقاق حق اعضای زیر مجموعه خود بپردازد و مسائل علمی را تنها با نگاه علمی و نه از نگاه سیاسی و حزبی بررسی کند تا بدین وسیله مورد اعتماد جامعه دانشگاهی قرار گیرد.
وی در ادامه نامه عنوان کرد: با اطمینان می‌گویم اگر این گونه تخلفات علمی که در تنافی آشکار با اخلاق و حقوق شهروندی است توسط صاحبان قدرت انجام شود و سپس از سوی کسانی چون جنابعالی توجیه شود، این امر، موجب تجری دیگران شده و ضربه جبران ناپذیری بر وجهه علمی دانشگاه وارد خواهد کرد و از همین رو بنده مصمم به پیگیری حقوقی و قضایی این موضوع در زمان مناسب هستم.
