برنامه کامل مسابقات لیگ شانزدهم از سوی سازمان لیگ مشخص و روز سه‌شنبه 20 بهمن‌ماه به فیفا ارسال شد. برنامه‌ای که به نظر می‌رسد نهایی است و با توجه به اینکه در فصل آینده تیم امید برنامه‌ای ندارد و همچنین برنامه‌های تیم ملی مشخص است، مسابقات فصل آینده با تعطیلات کمتری نسبت به لیگ پانزدهم برگزار خواهد شد.
اعلام برنامه یک‌ساله مسابقات لیگ در این مقطع در سال‌های اخیر خیلی کم اتفاق افتاده بود و معمولاً برنامه یک‌ساله سازمان لیگ پس از پایان لیگ مشخص می‌شد، اما برنامه‌ریزی‌ها به گونه‌ای پیش رفته که تیم‌ها بتوانند شرایط بهتری داشته باشند و برنامه‌ریزی مناسبی انجام دهند. تیم‌های لیگ برتر از حالا این فرصت را دارند تا برنامه‌ریزی خود را برای حضور هر چه بهتر در لیگ شانزدهم طرح‌ریزی کنند. نکته دیگری که در برنامه به چشم می‌خورد برگزاری 27 هفته از 30 هفته لیگ در روز‌های تعطیل است که باعث خواهد شد هواداران این فرصت را پیدا کنند تا بازی‌های تیم محبوب خود را با حضور در ورزشگاه تماشا کنند. همچنین 3 روز از رقابت‌های جام حذفی هم در ایام تعطیل برگزار می‌شود.
در برنامه لیگ شانزدهم بازی سوپر جام فوتبال ایران هم گنجانده شده که البته این بازی تقریباً یک هفته قبل از آغاز مسابقات لیگ برگزار می‌شود. پیش از این فقط یک بار سوپر جام فوتبال ایران برگزار شده که این اتفاق در سال 84 رخ داد و تیم‌های فولاد خوزستان و صبا باتری به عنوان قهرمان‌های مسابقات لیگ و جام حذفی به مصاف یکدیگر رفتند. قرار است از لیگ شانزدهم به بعد، مسابقات سوپرجام هر ساله از سوی سازمان لیگ برگزار شود.
تقویم کامل مسابقات لیگ شانزدهم به شرح زیر است:
یکشنبه، 20 تیرماه 95
قرعه‌کشی مسابقات لیگ برتر
جمعه اول مردادماه 95
سوپرجام فوتبال ایران
چهارشنبه 6 مردادماه 95
شروع شانزدهمین دوره لیگ برتر فوتبال
هفته اول: چهارشنبه و پنجشنبه، 6 و 7 مردادماه 95
هفته دوم: پنجشنبه و جمعه، 14 و 15 مردادماه 95
هفته سوم: پنجشنبه و جمعه، 21 و 22 مردادماه 95
هفته چهارم: پنجشنبه و جمعه، 28 و 29 مردادماه 95
تعطیلات اردوی تیم ملی
دوشنبه، 15 شهریورماه 95
پایان نقل و انتقالات شانزدهمین دوره لیگ برتر
هفته پنجم: جمعه و شنبه، 19 و 20 شهریورماه 95
هفته ششم: پنجشنبه و جمعه، 25 و 26 شهریورماه 95
هفته هفتم: سه‌شنبه و چهارشنبه، 30 و 31 شهریورماه 95
یکشنبه و دوشنبه، 4 و 5 مهرماه 95
مرحله اول جام حذفی (یک شانزدهم نهایی)
تعطیلات اردوی تیم ملی
هفته هشتم: جمعه و شنبه، 23 و 24 مهرماه 95
هفته نهم: پنجشنبه و جمعه، 29 و 30 مهرماه 95
هفته دهم: دوشنبه و سه‌شنبه، 3 و 4 آبان‌ماه 95
یکشنبه و دوشنبه، 9 و 10 آبان‌ماه 95
مرحله دوم جام حذفی (یک هشتم نهایی)
تعطیلات اردوی تیم ملی
پنجشنبه و جمعه، 27 و 28 آبان‌ماه 95
مرحله سوم جام حذفی (یک چهارم نهایی)
هفته یازدهم: پنجشنبه و جمعه، 4 و 5 آذرماه 95
هفته دوازدهم: پنجشنبه و جمعه، 11 و 12 آذرماه 95
هفته سیزدهم: پنجشنبه و جمعه، 18 و 19 آذرماه 95
جمعه، 26 آذرماه 95
مرحله چهارم جام حذفی (نیمه نهایی)
هفته چهاردهم: پنجشنبه و جمعه، 2 و 3 دی‌ماه 95
هفته پانزدهم: پنجشنبه و جمعه، 9 و 10 دی‌ماه 95
پنجشنبه، 16 دی‌ماه 95
شروع نقل‌وانتقالات نیم فصل
شروع نیم فصل دوم
هفته شانزدهم: پنجشنبه و جمعه 30 دی‌ماه و اول بهمن‌ماه 95
هفته هفدهم: پنجشنبه و جمعه، 7 و 8 بهمن‌ماه 95
پنجشنبه، 14 بهمن‌ماه 95
پایان نقل‌وانتقالات نیم فصل
هفته هجدهم: پنجشنبه و جمعه، 14 و 15 بهمن‌ماه 95
هفته نوزدهم: چهارشنبه و پنجشنبه، 20 و 21 بهمن‌ماه 95
هفته بیستم: پنجشنبه و جمعه، 28 و 29 بهمن‌ماه 95
هفته بیست‌ویکم: جمعه، شنبه و یکشنبه، 6، 7 و 8 اسفندماه 95
هفته بیست‌ودوم: جمعه و شنبه، 13 و 14 اسفندماه 95
تعطیلات اردوی تیم ملی
هفته بیست‌وسوم: جمعه و شنبه، 11 و 12 فروردین‌ماه 96
هفته بیست‌وچهارم: پنجشنبه و جمعه؛ 17 و 18 فروردین‌ماه 96
هفته بیست‌وپنجم: جمعه، شنبه و یکشنبه 25، 26 و 27 فروردین‌ماه 96
هفته بیست‌وششم: جمعه، اول اردیبهشت‌ماه 96
هفته بیست‌وهفتم: جمعه، شنبه و یکشنبه، 8، 9 و 10 اردیبهشت‌ماه 96
هفته بیست‌وهشتم: پنجشنبه، 14 اردیبهشت‌ماه 96
هفته بیست‌ونهم: یکشنبه، 24 اردیبهشت‌ماه 96
هفته سی‌ام: جمعه، 29 اردیبهشت‌ماه 96
چهارشنبه، 3 خردادماه 96
فینال جام حذفی فوتبال
