سعید لطفی ، بازیکن و پیشکسوت باشگاه استقلال در مصاحبه ای مدعی شده نکونام در دوران جوانی به عمد پای او را شکسته است: «مشکلی که من با جواد داشتم هیچ‌وقت حل نمی‌شود. او مسیر زندگی فوتبالی من را تغییر داد اما به انتقادات ربطی ندارد. من ابتدا که خبر نداشتم، بعداً در رختکن این را گفته است و نزدیکان خود جواد نکونام به من گفتند که او گفته بود از عمد پای من را شکسته است، ما هیچ مشکلی با هم نداشتیم، وقتی این اتفاق افتاد، زندگی‌ام عوض شد، خرده‌ای از ایشان در دل دارم اما جای خودش را دارد و انتقادات من ربطی به این مسأله ندارد، چرا تعریف‌ها و حمایت‌هایی که از استقلال کردم را نمی‌بینید اما انتقاداتم واکنش دارد، آخرین باری که حرف زدم قبل از شروع فصل بود، در طول فصل دیدید انتقادی کنم، فقط حمایت از تیم کردم.»
لطفی اعتقاد دارد نکونام در سطح استقلال نیست: «او باید برود و دانش‌اش را به روز کند، اکثر بچه‌هایی که فوتبال بازی کردند دانشش را دارند اما بحث انتقال دانش است، خیلی از ستاره‌های این کشور مربی شدند اما چون قدرت انتقال را نداشتند نتوانستند موفق شوند، ما برخلاف همه دنیا کار می‌کنیم، گواردیولا چند سال در رده‌های پایه کار کرد و دانشش را به روز کرد و نحوه انتقال دانش را هم یاد گرفت و آمد بارسلونا و شد گواردیولا!»
