شفر در فرودگاه امام (ره) و هنگام سفر استقلال به ترکیه جلوی ده‌ها خبرنگار و عکاس کلی از مدیران استقلال انتقاد کرد و گفت: عده‌ای تیمم را نابود کرده‌اند، اما به محض اینکه ۲۴ ساعت از سفر استقلال به ترکیه گذشت، ناگهان در مصاحبه‌ای به حمایت از افتخاری و توفیقی پرداخت و گفت: من با آن‌ها کاملاً هماهنگ هستم و ما با تیمی پرقدرت قدم به لیگ می‌گذاریم! جالب اینکه در ماجرای مخالفت شفر با برگزاری سوپرجام هم مدیران استقلال روی حرف مرد آلمانی حرف نزدند!
