کریم باقری مثل همیشه بی‌حاشیه و اخلاق مدار است. قطعا هر مربی دیگری جای او بود با جار و جنجال اهداف خود را پیش می‌برد. مشکل بزرگ کریم باقری در پرسپولیس این است که مسئولیت مشخصی ندارد. او به عنوان دستیار و یکی از مربیان پرسپولیس فعالیت می‌کند اما واقعیت این است که در کارهای فنی سرخ‌ها کوچک‌ترین دخالتی ندارد و نقشی که او درپرسپولیس ایفا می‌کند تمرین کردن با سایر بازیکنان است.
در واقع او در تمرینات یار کمکی سرخ‌ها محسوب می‌شود. برانکو کارهای فنی را هرگز به کریم باقری محول نمی‌کند و از دستیاران دیگر خود که هموطنش هستند بهره می‌برد. نداشتن نقش مشخص در تمرینات پرسپولیس باعث شده بود تا پیش از فصل اخبار متعددی درباره جدایی او به گوش برسد. کریم باقری هنوز هم ناراضی است اما این نارضایتی را هرگز نشان نمی‌دهد و اهل مصاحبه کردن هم نیست. اما شنیده می‌شود او به زودی از جمع سرخ‌ها جدا می‌شود، چیزی که هم خواسته برانکو است و هم خواسته خود کریم باقری.
