استقلال این فصل در شروع پر مشکل تر از استقلال فصل گذشته است. به این خاطر که استقلال فصل گذشته به دلیل ازیاد جذب بازیکن مجبور شد، چند بازیکن را کنار بگذارد که یکی از آنها کاوه رضایی بود اما استقلال این فصل با کمبود یار مواجه است و از سویی مدیر عامل هم ندارد! دیگر مشکلات استقلال و این مشکلات موجب شده تا در فضای رسانه ای بارها و بارها بحث استعفای جواد نکونام مطرح شود.
سرمربی تیم استقلال امروز در مصاحبه با خبرنگاران پاسخ شفافی به این ادعا داد. او گفت؛ آستانه ی تحمل وی این فصل تا هزار است. این بدین معنی است استعفایی در کار نیست و جواد نکونام به دلیل حمایت از سوی تماشاگران تا انتها به کار خود ادامه خواهد داد.
جواد نکونام فصل گذشته به دلیل پاره ای از مشکلات در جریان بازی های لیگ قهرمانان آسیا از سمت خود استعفاء کرد و او قصد ندارد این موضوع برای او تکرار شود. چرا که همین استعفاء برای او مشکلاتی به وجود آورد.
تماشاگران استقلال امروز هم با حضور در کمپ حجازی به شدت از جواد نکونام و شاگردانش حمایت کردند.
