این موزه به منظور بالا بردن سطح دانش عمومی جهان آفرینش و شناخت ارزش وجودی جانوران، گیاهان، کانیها و فسیلها در زندگی انسان و محیط زیست و پی بردن به قدرت نایزال پروردگار و کمک به آموزش بهتر علوم و نیز جبران کمبود آزمایشگاههای مجهز مربوط به علوم فوق و انجام قسمتی از رسالتی که یک دانشگاه پیشرفته از نظر آموزش و پژوهش بعهده دارد ایجاد شده است.
موزه تاریخ طبیعی شیراز در اسفند ماه ۱۳۵۳ تأسیس گردید و در اسفند ۱۳۵۹ به ساختمان کنونی آن در بلوار مدرس شیراز انتقال یافت.
در بخش جانورشناسی این موزه ۲۵۰۰ نمونه از بیمهرگان و مهرهداران (شامل دوزیستان و خزندگان و پرندگان) جمعآوری شده است، در بخش گیاهان زینتی و دارویی بیش از ۶۰ گونه گیاه دارویی، در بخش زمینشناسی فسیل ماهی با عمر۷۰ میلیون سال، کانیهای معدنی و انواع سنگها و فسیلها قرار دارد.
این موزه همچنین دارای بخشهای آناتومی، تکنولوژی، هنر، کارگاه فنی و تاکسیدرمی و بخش سمعی و بصری و کتابخانه است.