نخستین حکم تنفیذ ریاست‌جمهوری از سوی مقام معظم رهبری ، در ۱۲ مرداد ۱۳۶۸، پس از ارتحال امام خمینی(ره) بنیان‌گذار جمهوری اسلامی ایران و انتخاب آیت‌الله خامنه‌ای به رهبری انقلاب، صورت گرفت. در این مراسم که برای تنفیذ حکم نخستین دوره ریاست‌جمهوری مرحوم هاشمی‌رفسنجانی به عنوان چهارمین رئیس‌جمهور ایران در حسینیه جماران صورت گرفت، مقام معظم رهبری مرحوم هاشمی‌رفسنجانی را «مردی بزرگ از فرزندان اسلام و حوارییّن امام عظیم‌الشّأن، عالمی مجاهد و فقیهی اسلام‌شناس و سیاستمداری هوشمند و مدیری دردآشنا و دلسوز» توصیف کرد. مراسم تنفیذ حکم دومین دوره ریاست‌جمهوری مرحوم هاشمی‌رفسنجانی نیز مانند دوره اول در ۱۲ مرداد ۱۳۷۲ برگزار شد.
مقام معظم رهبری درآن حکم از هاشمی رفسنجانی چنین یاد کرد: «مردی بزرگ از سابقینِ نخستین انقلاب و از حوارییّن و انصار دیرین امام راحل. عالِمی متفکر، سیاستمداری هوشمند، فقیهی زمان‌شناس، مجاهدی خستگی‌نشناس، برادری مهربان برای ضعیفان و مدیری کاردان برای کشور.»
۱۲مرداد ۱۳۷۶، رهبر معظم انقلاب اسلامی با تنفیذ آرای ملت ایران به سید محمد خاتمی، وی را به ریاست‌جمهوری اسلامی ایران منصوب کردند. مقام معظم رهبری در آن حکم تنفیذ از خاتمی به عنوان «مردی روحانی و کارآزموده و انقلابی و اهل دانش و معرفت قرار یافته و یکی از تربیت‌شدگان حوزه معرفت دینی قدرت اجرایی را در کشوری به دست گرفته است که به برکت ایمان و دین‌باوری عمیق مردمش، پرچم‌دار نظام دینی و مفتخر به اجرای احکام اسلامی است» یاد کردند.
مراسم تنفیذ حکم دومین دوره ریاست‌جمهوری حجت‌الاسلام سیدمحمد خاتمی نیز ۱۱ مرداد ۱۳۸۰ در حسینیه امام خمینی (ره) برگزار شد. مقام معظم رهبری دراین حکم نیز خاتمی را «شخصیتی انقلابی و فرزانه و منتسب به بیت سیادت و علم و تقوا» توصیف کردند.
حکم ریاست‌جمهوری محمود احمدی‌نژاد، روز چهارشنبه دوازدهم مردادماه ۱۳۸۴ در حسینیه امام خمینی (ره) از سوی مقام معظم رهبری تنفیذ شد. مقام معظم رهبری در حکم تنفیذ برای احمدی‌نژاد از وی به عنوان «شخصیتی انقلابی و دانشمند و مدیری شایسته و کارآزموده و دارای سوابق مجاهدت صادقانه در صحنه‌های گوناگون» یاد کرد. دومین حکم تنفیذ برای احمدی‌نژاد در ۱۲ مرداد ۱۳۸۸ قرائت شد که مقام معظم رهبری از او به عنوان «مرد شجاع و سختکوش و هوشمند» یاد کردند.
۱۲ مرداد ۱۳۹۲ رهبر معظم انقلاب، با تنفیذ رای ملت در یازدهمین دوره انتخابات ریاست‌جمهوری، حسن روحانی را به ریاست‌جمهوری اسلامی ایران منصوب کردند. مقام معظم رهبری در آن حکم حسن روحانی را «شخصیتی دانشمند و کارآزموده میدان‌های گوناگون و دارای سوابق جهادی متعدد و مفتخر به حضور در مسوولیت‌های دینی و سیاسی به مدیریت اجرایی کشور» توصیف کردند.
مقام معظم رهبری در حکم تنفیذ دور دوم ریاست‌جمهوری حسن روحانی، وی را دانشمند محترم خطاب کردند.
شنبه ۱۲ مرداد ۱۴۰۰، مراسم تنفیذ حکم مرحوم ابراهیم رئیسی برگزار و مقام معظم رهبری در حکمشان از او به عنوان «شخصیتی مردمی و عالی‌قدر از تبار سیادت و علم، و مزین به پرهیزکاری و خردمندی و دارای سوابق درخشان مدیریت» یاد کردند.مقام معظم رهبری روز گذشته نیز در حکم تنفیذ ریاست‌جمهوری مسعود پزشکیان، او را «شخصیت فرزانه و صادق و مردمی و دانشمند» توصیف کردند.
