بر اساس ماده 3 آیین نامه مذکور، هرگونه های ایجاد تاسیسات اداری و زیر بنایی و تاسیسات مورد نیاز واحدهای اجرایی در این بازارچه ها و سایر سرمایه گذاریها و تامین کارکنان اجرایی و اداره آن بر عهده استانداری مربوطه است.
بنابر ماده 4 این آیین نامه ، وزارت کشورموظف شد از نظر احداث مکان و چگونگی حفظ انتظامات کنترل تردد افراد در بازارچه های مذکور هماهنگی های لازم را با گمرک ایران انجام دهد. در بند 5آیین نامه مذکور مدیریت بازارچه های مرزی به گمرک ایران واگذار شده است.
بر اساس ماده 6 این آیین نامه کوله بران از تخفیف عوارض وارداتی ماهیانه 500 هزار تومان برخوردار خواهند شد، همچنین سقف کلی این معافیت ها 900 میلیارد تومان میباشد.
ماده 10 این مصوبه تاکید دارد، وزارت کشور و نیروهای انتظامی مکلفند پس از لازم الاجرا شدن این مصوبه نسبت به انسداد کلیه معابر غیر مجاز اقدام کنند.