لیمو ترش بسیار اسیدی است و برای برخی افراد، این اسیدیته می‌تواند مشکلات گوارشی مانند رفلاکس اسید، سوزش سر دل، یا زخم معده را تشدید کند. افراد مبتلا به بیماری‌هایی مانند بیماری ریفلاکس معده (GERD) یا زخم معده ممکن است متوجه شوند که مصرف لیمو باعث بدتر شدن علائم آن‌ها می‌شود. در چنین مواردی، توصیه می‌شود برای جلوگیری از ناراحتی و تحریک، مصرف لیمو را محدود کنید یا از آن اجتناب کنید.
فرسایش مینای دندان: ماهیت اسیدی لیمو می تواند مینای دندان را به مرور زمان فرسایش دهد و منجر به حساسیت دندان و افزایش خطر پوسیدگی شود. مصرف منظم آب لیمو، به ویژه زمانی که رقیق نشده یا به مقدار زیاد باشد، می تواند به مشکلات دندانی کمک کند. برای به حداقل رساندن خطر، ضروری است که پس از مصرف لیمو، دهان را با آب بشویید و بهداشت دهان و دندان را رعایت کنید.
واکنش آلرژیک: آلرژی به مرکبات اگرچه غیرمعمول است، برخی از افراد ممکن است واکنش‌های آلرژیک به مرکبات مانند لیمو داشته باشند. علائم آلرژی به مرکبات می تواند از خارش خفیف یا کهیر تا واکنش‌های شدیدتر مانند تورم لب‌ها، زبان یا گلو متغیر باشد. افراد مبتلا به آلرژی به مرکبات باید از لیمو و سایر مرکبات اجتناب کنند تا از واکنش‌های نامطلوب جلوگیری کنند.
تداخلات دارویی: لیمو حاوی ترکیباتی به نام فورانوکومارین است که می تواند با تاثیر بر آنزیم‌های کبدی مسئول متابولیسم داروها با برخی داروها تداخل داشته باشد. افرادی که داروهای متابولیزه شده توسط این آنزیم ها مانند برخی استاتین ها، آنتی هیستامین ها یا رقیق کننده های خون مصرف می کنند، باید قبل از مصرف لیمو با پزشک خود مشورت کنند تا از تداخلات احتمالی جلوگیری کنند.
تحریک لثه: مصرف زیاد لیمو علاوه بر حساسیت دندان و فرسایش مینای دندان، به دلیل ماهیت اسیدی آن می‌تواند منجر به سایر مشکلات دندانی مانند تحریک لثه یا آفت‌ها شود. رقیق کردن آب لیمو در آب یا لذت بردن از آن به عنوان بخشی از یک وعده غذایی به جای مصرف آن به تنهایی می تواند به کاهش این خطرات کمک کند.
اگزالات و سنگ‌های کلیه: لیمو، مانند بسیاری از میوه ها و سبزیجات دیگر، حاوی اگزالات است، ترکیباتی که می تواند به تشکیل سنگ کلیه در افراد مستعد کمک کند. افرادی که سابقه سنگ کلیه دارند یا افرادی که مستعد مشکلات مربوط به اگزالات هستند ممکن است نیاز به تعدیل مصرف لیمو و سایر غذاهای پر اگزالات داشته باشند. اگزالات، ترکیبات آلی موجود در برخی مواد غذایی، از جمله گیاهان سالم مانند اسفناج و سیب زمینی شیرین است. با این حال، اگزالات به راحتی به برخی مواد معدنی از جمله کلسیم متصل می‌شود. کریستال‌های اگزالات کلسیم منشاء اصلی تشکیل سنگ کلیه هستند.
