علی مطهری در مصاحبه با سوره سینمای مهر گفته است: «شورای نگهبان افراد حر و آزاده را رد صلاحیت می کند و صلاحیت افراد چاپلوس را تأیید می کند.» او سه دوره است که نماینده مجلس است و از فیلتر تأیید شورای نگهبان عبور کرده است. او باید به این سؤال پاسخ دهد که آیا حضورش در سه دوره قانونگذاری، از زاویه تفسیر او از کارکرد شورای نگهبان چیست؟
رئیس جبهه مستقلین و اعتدالگرایان ایران با بیان اینکه تاکنون ۱۶ گزینه برای انتخابات ریاست جمهوری در دستورکار داریم، گفت: مطهری یکی از گزینه‌های جبهه مستقلین و اعتدالگرایان برای انتخابات ۹۶ است. وی افزود: جبهه مستقلین و اعتدالگران که حزب ما نیز در آن عضویت دارد در جلسه شورای مرکزی اخیر خود مصوب کرده است که نامزد نهایی خود را در دهه مبارک فجر اعلام کند.
نایب رئیس مجلس شورای اسلامی تصریح کرد: در ۹ دی ماه مردم ایران برای حفظ اساس انقلاب اسلامی به میدان آمدند.
علی مطهری با حضور در وزارت کشور برای ثبت نام نمایندگی مجلس نهم شورای اسلامی گفت: من مستقل کاندیدا می‌شوم اما در بین لیست‌های موجود لیست ۸ + ۷ را ترجیح می‌دهم.