بعد از ناکامی استقلال در کسب عنوان قهرمانی لیگ برتر، شایعات مختلفی در مورد آینده نکونام در استقلال شنیده می شود.
نکونام دو سال دیگر با استقلال قرارداد دارد ولی شنیده ها حاکی از آن است که مدیران هلدینگ خلیج فارس نمی خواهند با کادرفنی فعلی ادامه دهند. بزرگترین مشکل در راه جدایی نکونام از استقلال، مبلغ قرارداد بالای او است. نکونام با استقلال قراردادی ۳ ساله به مبلغ ۱۰۰ میلیارد تومان دارد. برای سال اول ۲۵ میلیارد، سال دوم ۳۵ میلیارد و برای سال آخر هم قرارداد نکونام با استقلال ۴۰ میلیارد تومان است.
در ابتدا گمان می شد اگر مدیران استقلال بخواهند نکونام را اخراج کنند، باید کل مبلغ قرارداد دو سال آینده را به او پرداخت کنند که مبلغ سنگینی می شود. با این حال شنیده ها حاکی از آن است که در قرارداد نکونام با استقلال بندی وجود دارد که در صورت عدم رضایت، مدیریت این باشگاه می تواند بدون پرداخت غرامت نکونام را کنار بگذارند.
بند جنجالی که به ضرر جواد خواهد شد و حالا مدیران استقلال بدون پرداخت غرامت می توانند دست به تغییر کادرفنی خود بزنند.