باقری در دوره قبلی به طور همزمان در پرسپولیس و تیم ملی کار کرد. البته در مقطعی که تیم ملی بازی داشت، رقابت های لیگ برتر فوتبال ایران تعطیل بود و حالا باید دید آیا آقا کریم قید قرارداد خود با پرسپولیس را میزند و به تیم ملی می رود یا نه؟
گفته میشود او با پرسپولیس قرارداد دو میلیارد و ۷۰۰ میلیونی داشت و در تیم ملی هم برای همان مدت کوتاه نزدیک به یک میلیارد تومان دریافت کرد. اسکوچیچ در چند مصاحبه تاکید کرد تا وقتی که در ایران است دوست دارد از کریم باقری استفاده کند.او به خوبی میداند که باقری بازیکنان را به خوبی مدیریت می کند و دنبال سرمربی شدن هم نیست. همان طور که در پرسپولیس به نوعی دستیار دوم یحیی محسوب می شود و گل محمدی به مراتب حمید مطهری را بیشتر از کریم باقری قبول دارد.